クリニックを開業するとき、あるいはリニューアルするとき、電子カルテ選びは経営を左右するほど重要な判断です。「どのメーカーがいいの?」「クラウド型とオンプレミス型って何が違うの?」と悩んでいる先生は多いはず。実際、電子カルテは一度導入するとなかなか乗り換えが大変で、最初の選択が数年先の業務効率に直結します。
この記事では、クリニック向け電子カルテの選び方のポイントと、タイプ別の特徴をわかりやすく整理しました。開業前の先生も、買い替えを検討中の先生も、ぜひ参考にしてみてください。

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医師転職ドットコムの公式サイトはこちら電子カルテの2つのタイプ|クラウド型とオンプレミス型
クラウド型電子カルテの特徴
クラウド型は、インターネット経由でデータをサーバーに保存するタイプです。院内に専用サーバーを設置する必要がなく、初期費用を大幅に抑えられるのが最大の特徴。費用の目安としては、初期費用が0円〜数十万円程度、月額費用が1万円〜5万円程度とされています。
メリットとしては、PCやタブレットがあればどこからでもアクセスできること、システムのアップデートやバックアップがサービス提供側で自動的に行われること、そして診療報酬改定への対応もベンダー側が担当してくれる点が挙げられます。
一方で、インターネット環境に依存するため、回線トラブル時に利用できなくなるリスクがあります。また、長期利用した場合のトータルコストはオンプレミス型のほうが安くなるケースもあります。
クラウド型を選ぶなら、診察室での使い方も一緒に考えておきたいところです。タブレットで入力する運用にする場合、卓上アーム式のスタンドがあると角度を固定でき、患者さんに画面を見せながら説明する動きもしやすくなります。
オンプレミス型電子カルテの特徴
オンプレミス型は、院内に専用サーバーを設置して、ソフトウェアをインストールして使うタイプです。初期費用の相場は200万円〜500万円と高額ですが、月々の保守費用は2万〜3万円程度に収まるのが一般的です。
院内ネットワークで完結するため、インターネット障害の影響を受けにくいのがメリット。カスタマイズの自由度も高く、自院の運用フローに合わせた細かい設定が可能です。ただし、サーバーの管理やデータバックアップは自院(もしくは保守契約先)で対応する必要があります。
ハイブリッド型という選択肢
近年注目されているのが、クラウド型とオンプレミス型の特徴を組み合わせた「ハイブリッド型」の電子カルテです。通常はクラウドでデータを管理しつつ、インターネット回線が切断された場合でも一定期間はローカルでカルテの閲覧・入力が可能な仕組みになっています。災害時の事業継続計画(BCP)対策としても注目されています。
コスト比較表
| 比較項目 | クラウド型 | オンプレミス型 |
|---|---|---|
| 初期費用 | 0円〜数十万円 | 200万〜500万円 |
| 月額費用 | 1万〜5万円 | 保守費2万〜3万円 |
| 5年間のトータルコスト | 約60万〜300万円 | 約320万〜680万円 |
| インターネット依存 | あり(回線トラブルに弱い) | なし(院内完結) |
| カスタマイズ性 | 限定的 | 高い |
| アップデート | 自動(ベンダー対応) | 手動(保守契約に依存) |
レセコン一体型と分離型の違い
電子カルテには、レセプトコンピュータ(レセコン)と一体になったタイプと、別々のシステムを連携させる分離型があります。
- 一体型:カルテ入力がそのまま会計処理やレセプト作成に反映される。データ連携の設定が不要で、運用がシンプル
- 分離型:電子カルテとレセコンを別々に選べるため、それぞれ好みのメーカーを組み合わせられる。ただし連携設定に手間やコストがかかる場合がある
開業準備でバタバタしがちな先生には、導入や運用がシンプルな一体型が人気です。一方で、すでにレセコンを導入済みの場合は、既存のレセコンと連携できる電子カルテを選ぶ分離型のほうがコストを抑えられるケースもあります。

電子カルテを選ぶときにチェックすべき5つのポイント
1. 操作性・入力のしやすさ
毎日使うものだから、操作性は妥協してはいけません。デモやトライアルを必ず試して、実際の診療の流れに沿って入力してみることが大切です。マウス操作中心なのか、キーボード入力が得意な先生向けなのかも確認しましょう。スタッフにも触ってもらい、受付や会計の操作感も確認しておくのがおすすめです。
ソフトの操作性と同じくらい効いてくるのが、画面の高さです。ノートPCをそのまま机に置くと目線が下がって首や肩に負担がかかるため、アルミ製のスタンドで底上げして外付けキーボードと組み合わせている先生もいます。
2. コスト(初期費用+ランニングコスト)
初期費用が安くても月額費用が高ければトータルでは割高になります。5年間のトータルコストで比較するのが賢い方法です。保守費用、アップデート費用、オプション料金なども含めて総額を確認しておきましょう。
3. サポート体制
診療時間中にトラブルが起きた場合、すぐに対応してもらえるかどうかは経営に直結します。電話サポートの対応時間、リモートサポートの有無、訪問対応の可否などを事前に確認することが重要です。「平日9時〜17時のみ対応」なのか「土曜日も対応可能」なのかで、使い勝手が大きく変わります。
4. 医療DXへの対応
厚生労働省は記事執筆時点で電子カルテの標準化を推進しており、電子カルテ情報共有サービスへの対応が今後の選定基準の一つになっていきます。標準型電子カルテの完成が進められているほか、標準仕様に準拠した製品の認証制度も整備される見込みです。将来を見据えて、標準規格に対応しているかどうかもチェックしておきましょう。
5. 診療科との相性
内科向け、眼科向け、皮膚科向けなど、診療科に特化したテンプレートや機能を備えた電子カルテもあります。自分の診療科でよく使う処方セットやオーダーが効率よく入力できるかは、日々の業務効率に大きく影響します。

クラウド型とオンプレミス型、どっちを選ぶべき?
結論から言うと、新規開業であればクラウド型を選ぶ先生が増えているのが現状です。初期費用が抑えられて、診療報酬改定への対応もベンダー任せにできるのは、忙しい開業医にとって大きなメリットです。クリニック向けではクラウド型のシェアが急速に拡大しています。
ただし、すべてのクリニックにクラウド型が合うわけではありません。以下のような先生はオンプレミス型のほうが向いている場合もあります。
- インターネット環境が不安定な地域にクリニックがある
- 独自のカスタマイズを細かく行いたい
- 長期間(10年以上)同じシステムを使い続ける予定がある
- データを自院内で完全に管理したい
自院の状況に合わせて、実際にメーカーに見積もりを取りながら検討していくのがベストです。
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医師転職ドットコムの公式サイトはこちら導入前に確認しておきたいこと
電子カルテの導入に際しては、以下の点も忘れずに確認しましょう。
- データ移行:紙カルテや既存の電子カルテからのデータ移行が可能か、費用はいくらか
- スタッフへの研修:導入時のトレーニングはどの程度提供されるか
- 契約期間と解約条件:クラウド型の場合、最低契約期間の縛りがないか
- IT補助金の活用:国のIT導入補助金を活用できる製品かどうか
- 他システムとの連携:予約システム、検査機器、画像管理システムとの連携が可能か
特にデータ移行は見落としがちなポイントです。移行費用だけで数十万円かかるケースもあるので、事前に確認しておくことをおすすめします。
あわせて考えておきたいのが停電対策です。診療中に電源が落ちると入力途中のカルテが飛ぶおそれがあるため、院内サーバーや受付端末に無停電電源装置(UPS)をかませておく院もあります。落雷や瞬電の多い地域では特に検討する価値があります。
IT補助金の活用方法
国の「IT導入補助金」を活用すれば、電子カルテの導入費用を大幅に抑えることが可能です。補助率や上限額は年度によって変わりますが、導入費用の最大1/2〜2/3が補助されるケースもあります。
IT導入補助金の対象となる電子カルテは、IT導入支援事業者として登録されたベンダーの製品に限られます。導入を検討しているメーカーが対象かどうか、事前に確認しておきましょう。申請の手続きはやや煩雑ですが、数十万円〜100万円以上の補助が受けられる可能性があるので、活用しない手はありません。

よくある質問(Q&A)
Q. 電子カルテの導入にはどれくらいの期間がかかる?
クラウド型であれば最短で1〜2週間、オンプレミス型では1〜3か月が目安です。スタッフの研修期間も含めると、余裕を持って開業の2〜3か月前には契約を済ませておくのが理想的です。
Q. 途中でメーカーを変えることはできる?
可能ですが、データ移行の手間と費用がかかります。特にオンプレミス型からクラウド型への乗り換えは、データ形式の違いから移行が複雑になるケースもあります。最初の選択が重要と言われるのはこのためです。
Q. AI機能搭載の電子カルテは選ぶべき?
記事執筆時点では、AI機能を搭載した電子カルテも増えてきています。音声入力やAIによる所見サジェストなどの機能が搭載されているものもありますが、あくまで補助的なものです。まずは基本的な操作性とサポート体制を重視して選ぶのが良いでしょう。
Q. 紙カルテからの移行は大変?
過去のカルテをすべてデータ化するのは現実的ではないため、多くの場合は「電子カルテ導入後の新しい診療分からデータを蓄積し、過去の紙カルテは参照用として保管する」という運用になります。移行の負担は想像よりも少ないケースが多いです。
まとめ
電子カルテは、クリニック経営の土台となるシステムです。クラウド型は初期費用が安く導入しやすい反面、オンプレミス型はカスタマイズ性とインターネットに依存しない安定性が魅力。ハイブリッド型という新しい選択肢も登場しています。自院の規模・診療科・予算・将来ビジョンを踏まえて、複数のメーカーを比較検討することが大切です。
デモやトライアルを積極的に活用して、自分の手で触って確かめてから決断しましょう。
参考:エムスリーデジカル 電子カルテ比較 | ウィーメックス 電子カルテ比較ガイド | CLINICS 電子カルテの費用
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